本科论文查重与学术诚信建设的长期目标是维护学术界的公平与正义，促进学术研究的健康发展。通过查重，可以杜绝学术造假现象，保障学术成果的真实性和可信度。同时，加强学术诚信建设，有利于提高学术水平，促进学术进步，推动学术界朝着更加规范化、专业化的方向发展，为学术研究提供更加可靠的基础。

本科论文查重与学术诚信建设的长期目标还包括培养学术诚信意识，推动学术规范化建设，提高学术研究的质量和水平。通过加强查重工作和学术诚信建设，可以有效减少学术不端行为，提升学术研究的公正性和透明度，增强学术界的凝聚力和创新力，为学术界的长远发展打下坚实基础。